Указ об освящении новопостроенной Покровской церкви был выдан Московской духовной консисторией в 1750 году и село после этого стало называться Покровское-Рубцово. В это время в сельце Рубцове насчитывалось «мужского и женского полу сто пятьдесят душ». В 1786 году усадьба Покровское-Рубцово перешла к Павлу Ивановичу Голохвастову, а с 1891 года ее владельцем стал Савва Тимофеевич Морозов.
Покровская церковь сооружена в стиле барокко. Оригинальное по композиции здание храма принадлежит к довольно редкому в Подмосковье центрическому четырех-лепестковому типу храмов. Предшествующим ему аналогом является Знаменская церковь в Перово, а ровесницей – усыпальница в усадьбе Полуэтово («Волынщина»). В XIX веке к храму была пристроена обширная трапезная и трехъярусная колокольня, в конце столетия церковь и кладбище были обнесены каменной оградой.
В годы гонений храм не закрывался. В 1920 году в храме служил священник Сергей Орлов, прославленный в лике новомучеников и исповедников Российских. В 1972-1974 годах в храме проводились реставрационные работы.